《火影忍者》中，木叶丸是第三代火影猿飞日斩的孙子。在故事设定中，木叶丸的父亲是猿飞木毅，而他的母亲则是水户门炎的女儿——水户门蝶。木叶丸自小就展现出极高的忍者天赋，并且深受三代目火影的喜爱。

木叶丸在动画和漫画中首次登场是在《火影忍者》第二部“疾风传”中，那时他还是一个活泼可爱的小孩。他对第七班的成员——特别是漩涡鸣人非常崇拜，常常模仿鸣人的行为。木叶丸拥有瞬身术，这使得他在战斗中可以快速移动，具有很高的机动性。此外，他还掌握了通灵之术，能够召唤出蛤蟆进行协助作战。

随着剧情的发展，木叶丸逐渐成长为一位优秀的年轻忍者，他与同龄的伙伴们一起经历了许多挑战和冒险，也展现出了自己的领导能力和责任感。